第104章 化学是实验的科学
肖宿接过打印稿,低头认真翻阅起来。
万汇杨接着说道:“我们采用的是密度泛函理论框架,结合多体微扰论进行修正。然而,在处理某些特定类型的分子时,计算结果与实验数据始终存在偏差。”
“我反复检查了算法实现过程,也尝试调整了各种参数,可误差依旧无法消除。”
他稍作停顿,指着打印稿上的一页:
“后来我读到你的那篇论文,里面的度量方法,我认为可用于描述我们模型中的某些奇异性。于是便尝试将其移植过来。”
万汇杨苦笑着摇摇头:“结果折腾了两个月,代码写了好几版,要么无法收敛,要么收敛后数值完全不对。”
顾清尘在一旁打趣:“老万,你那学生不是挺厉害的吗?你可没少跟我夸他,怎么没帮忙看看?”
万汇杨无奈地摇摇头,叹了口气,对顾清尘道:“清尘,你啊你啊,还是这么不吃亏啊,我不就跟你说过两次,现在还打趣我……”
话未说完,办公室的门被敲响。
“请进。”
门被推开,一个二十七八岁的年轻人走了进来。
他身材高挑,身着深蓝色实验室大褂,五官端正,眉眼间透着一股年轻人特有的锐气。
进门后看到肖宿,明显愣了一下。
“万老师,这位是……”
万汇杨笑道:“方清,你来得正好。来,我给你介绍一下,这位是数学院的肖宿,你应该听说过了吧。”
方清的表情瞬间变得微妙起来。
这就是肖宿?
那个十五岁就证明了周氏猜想的天才?
他自然听说过。
不仅听说过,前段时间组里讨论肖宿发表在《数学发明》上的论文时,他还认真研读了一番。
计算化学虽然属于化学专业,但是对数学知识的要求十分高,方清在京大本硕博连读,数学功底也是十分扎实的。
可是,那些关于“有理双曲奇点”的构造,他还是看得云里雾里。
要理解它所需的数学背景太过深厚了。
可问题是,那是纯数学的内容,化学,终究还是实验的科学。
作用还是有限的。
“肖宿同学,这是我学生方清。”
万汇杨介绍道,“也是我们组的主力,如今已是博士三年级。方清,肖宿同学是来帮我们解决模型问题的。”
方清点点头,朝肖宿礼貌地打了个招呼:“久仰。”
他在肖宿对面坐下,目光扫过桌上那叠打印稿,又看了看肖宿那张年轻的脸,心中不禁泛起嘀咕。
万老师这是病急乱投医了吗?
计算化学中数学虽然很重要,可终究是化学的领域,即便再天才的数学家,难道看一眼化学问题就能找出症结所在?
化学与数学之间的壁垒,哪有那么容易打破?
万汇杨并未留意方清的表情,继续与肖宿探讨技术细节。
肖宿翻看着打印稿,时不时提出一两个问题。
“这个哈密顿量用的是哪个基组?”
“cc - pVTZ,相关一致极化价层三zeta基组,处理过渡金属时加了有效核势。”万汇杨迅速答道。
肖宿点点头,又问:“自洽场迭代的收敛判据是多少?”
“默认的,10的负8次方。”
肖宿翻到某一页,手指轻点公式:“这个地方的交换相关泛函,用的是杂化型的?”
万汇杨眼睛一亮:“对,B3LYP。你怎么看出来的?”
肖宿并未回答,继续往下翻阅。
方清在一旁看着,心中不禁有些惊讶。
这些问题问得十分专业,绝非随意翻阅就能问出来的。
但转念一想,搞计算化学的人也都会问这些,关键还得看能否找到问题的根源。
他忍不住开口:“肖宿同学,其实我们遇到的主要问题,在于处理分子对称性时。一些高对称性的构型,计算结果总是偏离实验值。万老师尝试将你的度量方法加进去,却似乎不太兼容。”
这话虽委婉,但潜台词很明显:你的方法我们试过了,没什么效果。
肖宿抬起头,目光平静地看向方清。
那眼神波澜不惊,却让方清莫名感到一丝压力。
“你们的实现方式存在问题。”肖宿直言。
方清一愣:“什么问题?”
肖宿并未直接回应,而是从书包里掏出笔,在打印稿的空白处画了几笔。
“你刚才提到,分子属于C2v点群?”
方清点头:“没错。空间群是C2v,有四个对称操作:恒等操作、绕z轴的二重旋转、以及两个镜面反射。我们在构造哈密顿量时,已将这些对称性考虑在内。”
肖宿在几笔旁边写下一个公式:“你们的模型中,这个系数应当满足对称性约束。但在处理奇点附近时,你们破坏了这种约束。”
方清盯着那个公式,眉头紧锁。
那个系数他自然知晓,是哈密顿量里某个关键项的权重因子。
按照对称性要求,在C2v群的作用下,它应保持不变。
可肖宿所画奇点附近的区域,他仔细思索后发现,似乎在数值离散化时,为处理奇异性,他们做的某种近似处理……
难道真的破坏了对称性?
万汇杨凑过来,盯着肖宿画的图看了许久,突然一拍大腿。
“我明白了!”
他猛地站起身,在办公室里来回踱步,嘴里念念有词:
“对对对,我们在奇点附近采用了非结构网格,网格划分时未考虑对称性约束,致使那个系数在对称操作下不再相等。所以计算出的能量本征值才会出现偏差!”
方清愣住了。
他看向肖宿画的几笔,又看看那个公式,大脑飞速运转。
经万老师这么一说,似乎确实如此……
若对称性被破坏,哈密顿量的本征谱便会分裂出原本不该存在的能级,或者某些能级的简并度被错误解除。
这将导致计算出的能量与实验值不符,且偏差规律与分子对称性相关。
可是——
“万老师,”方清忍不住说道,“那个区域是非结构网格,要严格保持对称性,网格划分的复杂度会大幅提高。况且我们用的是现成的有限元库,其网格生成器并不支持对称性约束。”
肖宿看向他,语气平淡:“无需重新划分网格。”
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